On peut simplement végétaliser sa mare, la simple présence de végétaux va enclencher un écosystème d’épuration naturel. Il existe cependant des techniques plus complexes et plus efficaces, si l’on veut épurer l’eau selon les normes françaises, afin de la rejeter dans un milieu naturel.
Le lagunage : Pour cette technique, il est nécessaire d’installer différents paliers de filtration. Ces paliers sont en fait des bacs étanches, où l’eau en trop-plein va être déversée et filtrée. A la fin de la série de bacs, l’eau pourra être déversée dans une autre mare ou bien dans le milieu naturel. Différentes plantes peuvent être utilisées, comme la jacinthe d’eau, réputée très efficace ou bien l’iris ou le jonc. Il convient de commencer par planter des microphytes puis passer aux macrophytes dans les derniers bassins. Le substrat utilisé sera de la pouzzolane avec du terreau si nécessaire ainsi que du gravier. Ce mélange permettra de filtrer l’eau, accueillir les bactéries et permettre aux plantes de se développer. Il convient aussi de laisser un regard sur l’eau pour s’assurer qu’elle se déverse bien et qu’elle est bien épurée.

La rhizosphère : L’eau de la mare va être acheminée via un trop-plein vers une rhizosphère de phragmites. L’eau, en traversant la rhizosphère, va être filtrée puis rejetée dans une autre mare ou bien un courant d’eau en aval. Pour ce type d’installation, il est nécessaire d’isoler la rhizosphère dans un contenant imperméable. La profondeur idéale est de 60 cm et d’une taille finale de 2 à 3 m3. Un substrat assez hétérogène sera privilégié. En effet, il permettra à la rhizosphère de bien s’implanter et donnera un substrat suffisamment solide et favorable pour les microorganismes. On peut donc faire un mélange de différents substrats (exclure le sable et le gravier). En hiver, bien que les feuilles se raréfient, le système fonctionne toujours car l’oxygène est capté par les tiges et transporté vers les racines qui continuent leur activité.