Un équilibre doit exister au sein du peuplement de poissons afin qu’il y ait une autorégulation des populations. On y retrouve donc des poissons herbivores, omnivores et piscivores. Les espèces de carnassier adaptées à la mare sont le Brochet et la Perche commune. Les carpes sont à éviter et en particulier l’Amour blanc. Uniquement herbivores, ces espèces fouisseuses peuvent être hypers sélectives et s’attaquer aux végétations des berges, pour laisser les espèces les plus indésirables coloniser le plan d’eau. La Tanche est à privilégier car elle est beaucoup moins fouisseuse. Une densité de population trop dense de poissons fouisseurs (Carpe, Tanche, Brème) est néfaste pour le plan d’eau (turbidité de l’eau, surpâturage, …). D’autres poissons comme le Gardon et le Rotangle ont une taille et des mœurs bien adaptées à la mare. Ils seront également très appréciés par les oiseaux piscivores ou dans l’assiette en friture.
Certaines espèces sont classées EEE (Espèces Exotiques Envahissantes). L'introduction sur le territoire national, la détention, le transport, le colportage, l'utilisation, l'échange, la mise en vente, la vente ou l'achat de tout spécimen vivant des espèces suivantes est interdite : Perche soleil, Poisson chat, Pseudo-rasbora, Gobie, Carassin, Ecrevisse américaine, de Louisiane et signal.
L’introduction de poissons doit se faire en hiver afin de limiter les chocs osmotiques liés à la température de l’eau et à son éventuelle concentration en matière organique (les poissons d’élevage sont souvent élevés dans une eau fraîche et très oxygénée, très différente de l’eau de la mare en dehors de l’hiver).
Il est fortement conseillé d’introduire progressivement les poissons et d’observer sur de longues périodes les éventuels impacts sur le milieu (tolérance des caractéristiques du milieu, turbidité de l’eau, surpâturage, sur-prédation, …)
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